В Красноярске расшифровали геном лиственницы
18 февраля 2019 года | Россия
Рубрика: Лесные ресурсы
Ядерные геномы хвойных имеют громадный размер, в 4−9 раз превыщающий геном человека и состоящий на 70−80% из высокоповторяющихся элементов. Это в значительной степени затрудняет их анализ, и в мире существуют только две команды учёных, сумевших расшифровать геном хвойного дерева.
«Нам удалось разработать и реализовать уникальную методику поэтапной сборки генома „по частям“, которая позволяет обойти ограничения современных ассемблеров и получить надёжную сборку генома сибирской лиственницы, соответствующую исходному биологическому материалу, — сообщил заведующий кафедрой высокопроизводительных вычислений ИКИТ, кандидат технических наук Дмитрий Кузьмин. — Наша методика позволяет осуществлять относительно быструю сборку очень больших геномов на сравнительно небольших объёмах вычислительных ресурсов».
Другим важным результатом исследования стала расшифровка хлоропластного генома лиственницы сибирской, его сравнение с хлоропластными геномами других хвойных и обнаружение однонуклеотидных полиморфизмов. Ранее результаты этого исследования опубликованы в журнале BMC Bioinformatics.
Лесные ресурсы — последние новости
19 апреля | Россия
4 апреля | Россия
25 марта | Соединенные Штаты Америки (США)
23 марта | Франция
14 марта | Россия
Россия — последние эко-новости
19 апреля | Рубрика: Климат и атмосфера
19 апреля | Рубрика: Лесные ресурсы
17 апреля | Рубрика: Водные ресурсы
16 апреля | Рубрика: Флора и фауна
13 апреля | Рубрика: Климат и атмосфера